Klasifikasi kanker berdasarkan data RNA menggunakan Dilated Convolutional Neural Network

This item is published by Universitas Islam Negeri Sunan Ampel Surabaya

Syarifudin, Mohammad Anang (2021) Klasifikasi kanker berdasarkan data RNA menggunakan Dilated Convolutional Neural Network. Undergraduate thesis, UIN Sunan Ampel Surabaya.

Text
Mohammad Anang Syarifudin_H02217009.pdf
Download (2MB)

Abstract

Berdasarkan statistik dari WHO, kanker merupakan salah satu penyakit paling mengancam di dunia. Sebanyak 13% kematian di dunia disebabkan oleh kanker dan terus meningkat setiap tahunnya. Karsinoma merupakan kanker yang paling sering ditemukan pada manusia yaitu 90% dari seluruh kasus kanker di dunia. Salah satu parameter yang dapat digunakan dalam mendeteksi kanker karsinoma yaitu ekspresi RNA. Pada penelitian ini akan dilakukan deteksi kanker berdasarkan ekspresi RNA ke dalam 5 kelas yaitu Breast Carcinoma (BRCA), Kidney Renal clear cell Carcinoma (KIRC), Uterine Corpus Endometrial Carcinoma (UCEC), dan Lung Adenocarcinoma (LUAD) menggunakan metode Dilated Convolutional Neural Network. Beberapa percobaan dilakukan untuk mendapatkan hasil yang terbaik, diantaranya yaitu merubah nilai faktor dilasi dan membandingkan model yang menggunakan augmentasi data atau tanpa menggunakan augmentasi data. Hasil akurasi terbaik yang didapatkan yaitu 99.24% dengan sensitifitas sebesar 98.70%.