Optimasi Isolasi DNA dan Protokol PCR (Polymerase Chain Reaction) untuk Identifikasi Khamir dari Sarang Lebah Madu Apis mellifera

This item is published by Universitas Islam Negeri Sunan Ampel Surabaya

Arifa, Ayudya Fitri (2020) Optimasi Isolasi DNA dan Protokol PCR (Polymerase Chain Reaction) untuk Identifikasi Khamir dari Sarang Lebah Madu Apis mellifera. Undergraduate thesis, UIN Sunan Ampel Surabaya.

Text Ayudya Fitri Arifa_H71216051.pdf Download (1MB)

Abstract

Khamir merupakan mikroorganisme dari Kingdom Fungi yang dapat ditemukan di dalam sarang lebah madu. Identifikasi khamir merupakan proses untuk menemukan dan memberikan identitas pada spesies baru. Salah satu metode untuk identifikasi molekular pada spesies khamir yaitu dengan menggunakan sekuen rDNA (DNA ribosomal) pada daerah ITS (Internal Transcribed Spacer). Sebelum dilakukan identifikasi molekular, penting dilakukan sebuah trial atau optimasi metode isolasi dan amplifikasi DNA khamir, sehingga akan diperoleh produk hasil amplifikasi untuk menghasilkan sekuen DNA khamir yang baik dalam memudahkan proses identifikasi spesies dan analisis filogenetik. Tujuan penelitian ini yaitu mengetahui metode isolasi DNA dan protokol PCR (Polymerase Chain Reaction) yang optimum untuk identifikasi khamir dari sarang lebah madu Apis mellifera. Penelitian ini menggunakan 2 referensi metode isolasi DNA yaitu dari protokol Wizard® Genomic DNA Purification Kit TM050 yang telah dimodifikasi dengan penggunaan enzim proteinase K, sedangkan metode lainnya dari Kanti et al. (2018) yaitu metode boilling. Penelitian ini juga menggunakan 3 referensi protokol PCR yaitu dari Kanti et al. (2018), Ediningsari (2008), dan Maulana (2011). Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa metode isolasi DNA dan protokol PCR yang optimum digunakan untuk identifikasi khamir dari sarang lebah madu Apis mellifera yaitu metode dari Kanti et al. (2018) yang menghasilkan produk isolasi DNA dengan nilai kemurnian yang berada direntang 1,8-2,0 dan nilai konsentrasi yang cukup tinggi yaitu 10,32-20,06 sehingga dapat digunakan sebagai DNA template pada amplifikasi DNA khamir dan protokol PCR dari Maulana (2011) yang menghasilkan pendaran fragmen DNA yang utuh, jelas, dan tebal dengan panjang berturut-turut 504, 504, 588, dan 444 bp.

Statistic

Downloads from over the past year. Other digital versions may also be available to download e.g. from the publisher's website.

Item Type:	Thesis (Undergraduate)
Creators:	Creators Email NIM Arifa, Ayudya Fitri ayudyafitri15@gmail.com H71216051
Contributors:	Contribution Name Email NIDN Thesis advisor Firdhausi, Nirmala Fitria nirmala_firdhausi@yahoo.com 2025068501 Thesis advisor Hidayati, Irul irulhidayati.alfatawi@gmail.com 198102282014032001
Subjects:	Biologi Serangga
Keywords:	Apis mellifera; Isolasi DNA; Khamir; Protokol PCR.
Divisions:	Fakultas Sains dan Teknologi > Studi Biologi
Depositing User:	Ayudya Arifa
Date Deposited:	22 Aug 2020 02:06
Last Modified:	22 Aug 2020 02:06
URI:	http://digilib.uinsa.ac.id/id/eprint/43012

Actions (login required)

View Item